MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella sp. TX077308 chromosome

Total Repeats: 44578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015696	A	8	8	170	177	100 %	0 %	0 %	0 %	337754018
2	NC_015696	A	9	9	179	187	100 %	0 %	0 %	0 %	337754018
3	NC_015696	TAA	2	6	266	271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754018
4	NC_015696	A	6	6	282	287	100 %	0 %	0 %	0 %	337754018
5	NC_015696	CAA	2	6	322	327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337754018
6	NC_015696	AGA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337754018
7	NC_015696	GTG	2	6	343	348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337754018
8	NC_015696	TAA	2	6	368	373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754018
9	NC_015696	A	6	6	372	377	100 %	0 %	0 %	0 %	337754018
10	NC_015696	TTC	2	6	392	397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337754018
11	NC_015696	T	6	6	428	433	0 %	100 %	0 %	0 %	337754018
12	NC_015696	A	6	6	439	444	100 %	0 %	0 %	0 %	337754018
13	NC_015696	GAT	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754018
14	NC_015696	GAA	2	6	468	473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337754018
15	NC_015696	A	6	6	522	527	100 %	0 %	0 %	0 %	337754018
16	NC_015696	ATT	2	6	542	547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754018
17	NC_015696	TGA	2	6	554	559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754018
18	NC_015696	GAT	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754018
19	NC_015696	CAAA	2	8	655	662	75 %	0 %	0 %	25 %	337754018
20	NC_015696	AGC	3	9	671	679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337754018
21	NC_015696	ATT	2	6	719	724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754018
22	NC_015696	TA	3	6	725	730	50 %	50 %	0 %	0 %	337754018
23	NC_015696	TGG	2	6	731	736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337754018
24	NC_015696	TTA	2	6	835	840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754018
25	NC_015696	CAAGAT	2	12	867	878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337754018
26	NC_015696	AG	3	6	886	891	50 %	0 %	50 %	0 %	337754018
27	NC_015696	TTC	2	6	910	915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337754018
28	NC_015696	GAT	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754018
29	NC_015696	AAGG	2	8	945	952	50 %	0 %	50 %	0 %	337754018
30	NC_015696	ATT	2	6	1008	1013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754018
31	NC_015696	GAA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337754018
32	NC_015696	A	6	6	1140	1145	100 %	0 %	0 %	0 %	337754018
33	NC_015696	CAG	2	6	1180	1185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337754018
34	NC_015696	GTAC	2	8	1203	1210	25 %	25 %	25 %	25 %	337754018
35	NC_015696	AG	3	6	1218	1223	50 %	0 %	50 %	0 %	337754018
36	NC_015696	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337754018
37	NC_015696	GCTT	2	8	1299	1306	0 %	50 %	25 %	25 %	337754018
38	NC_015696	AAGAA	2	10	1327	1336	80 %	0 %	20 %	0 %	337754018
39	NC_015696	ATA	2	6	1348	1353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754018
40	NC_015696	AAG	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337754018
41	NC_015696	ACT	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337754018
42	NC_015696	TGA	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754018
43	NC_015696	TAAA	2	8	1620	1627	75 %	25 %	0 %	0 %	337754018
44	NC_015696	TAT	2	6	1745	1750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754019
45	NC_015696	AAT	2	6	1777	1782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754019
46	NC_015696	GAT	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754019
47	NC_015696	ATT	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754019
48	NC_015696	TAA	2	6	1959	1964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754019
49	NC_015696	AGCA	2	8	2030	2037	50 %	0 %	25 %	25 %	337754019
50	NC_015696	CAA	2	6	2053	2058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337754019
51	NC_015696	TCA	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337754019
52	NC_015696	ATG	2	6	2102	2107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754019
53	NC_015696	TAG	2	6	2207	2212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754019
54	NC_015696	AGA	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337754019
55	NC_015696	CTT	2	6	2428	2433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337754019
56	NC_015696	ATCT	2	8	2475	2482	25 %	50 %	0 %	25 %	337754019
57	NC_015696	AT	3	6	2516	2521	50 %	50 %	0 %	0 %	337754019
58	NC_015696	AGA	2	6	2571	2576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337754019
59	NC_015696	TCT	2	6	2634	2639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337754019
60	NC_015696	GAA	2	6	2662	2667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337754019
61	NC_015696	ATA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754019
62	NC_015696	TCA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337754019
63	NC_015696	TCA	2	6	2844	2849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337754020
64	NC_015696	TAT	2	6	2857	2862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754020
65	NC_015696	T	8	8	2865	2872	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
66	NC_015696	T	6	6	2969	2974	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
67	NC_015696	AGA	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337754020
68	NC_015696	T	6	6	3059	3064	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
69	NC_015696	T	7	7	3116	3122	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
70	NC_015696	TA	3	6	3163	3168	50 %	50 %	0 %	0 %	337754020
71	NC_015696	T	6	6	3179	3184	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
72	NC_015696	AGT	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754020
73	NC_015696	TTC	2	6	3254	3259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337754020
74	NC_015696	T	8	8	3291	3298	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
75	NC_015696	T	6	6	3307	3312	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
76	NC_015696	T	6	6	3318	3323	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
77	NC_015696	AGGG	2	8	3335	3342	25 %	0 %	75 %	0 %	337754020
78	NC_015696	AT	3	6	3372	3377	50 %	50 %	0 %	0 %	337754020
79	NC_015696	T	6	6	3381	3386	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
80	NC_015696	TGAA	2	8	3390	3397	50 %	25 %	25 %	0 %	337754020
81	NC_015696	T	6	6	3405	3410	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
82	NC_015696	CAA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337754020
83	NC_015696	AAT	2	6	3422	3427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754020
84	NC_015696	ATTT	2	8	3438	3445	25 %	75 %	0 %	0 %	337754020
85	NC_015696	TAA	2	6	3473	3478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754020
86	NC_015696	T	6	6	3488	3493	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
87	NC_015696	ATA	2	6	3514	3519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754020
88	NC_015696	T	6	6	3526	3531	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
89	NC_015696	CAT	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337754020
90	NC_015696	TGC	2	6	3556	3561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337754020
91	NC_015696	T	6	6	3617	3622	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
92	NC_015696	TAT	2	6	3633	3638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754020
93	NC_015696	TTA	2	6	3645	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754020
94	NC_015696	ATCT	2	8	3657	3664	25 %	50 %	0 %	25 %	337754020
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98	NC_015696	T	6	6	3707	3712	0 %	100 %	0 %	0 %	337754020
99	NC_015696	ATTT	2	8	3766	3773	25 %	75 %	0 %	0 %	337754020
100	NC_015696	AAAAT	2	10	3837	3846	80 %	20 %	0 %	0 %	337754020
101	NC_015696	AAG	2	6	3858	3863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337754020
102	NC_015696	A	8	8	3868	3875	100 %	0 %	0 %	0 %	337754020
103	NC_015696	AAT	2	6	3896	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754020
104	NC_015696	A	7	7	4081	4087	100 %	0 %	0 %	0 %	337754021
105	NC_015696	CTT	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337754021
106	NC_015696	AGC	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337754021
107	NC_015696	AGC	2	6	4180	4185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337754021
108	NC_015696	TTA	2	6	4238	4243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754021
109	NC_015696	ATT	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754021
110	NC_015696	ACA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337754021
111	NC_015696	AT	3	6	4393	4398	50 %	50 %	0 %	0 %	337754021
112	NC_015696	TTC	2	6	4399	4404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337754021
113	NC_015696	TA	3	6	4405	4410	50 %	50 %	0 %	0 %	337754021
114	NC_015696	ACTT	2	8	4447	4454	25 %	50 %	0 %	25 %	337754021
115	NC_015696	ATT	2	6	4506	4511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754021
116	NC_015696	ATA	2	6	4589	4594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754021
117	NC_015696	AGC	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337754021
118	NC_015696	TTCA	2	8	4608	4615	25 %	50 %	0 %	25 %	337754021
119	NC_015696	TGG	2	6	4624	4629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337754021
120	NC_015696	ATTC	2	8	4701	4708	25 %	50 %	0 %	25 %	337754021
121	NC_015696	CAG	2	6	4737	4742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337754021
122	NC_015696	A	6	6	4759	4764	100 %	0 %	0 %	0 %	337754021
123	NC_015696	AGT	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754021
124	NC_015696	TAT	2	6	4800	4805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754021
125	NC_015696	TA	3	6	4807	4812	50 %	50 %	0 %	0 %	337754021
126	NC_015696	TAT	2	6	4815	4820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754021
127	NC_015696	TGG	2	6	4837	4842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337754021
128	NC_015696	TTA	2	6	4962	4967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754021
129	NC_015696	TAT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754021
130	NC_015696	AAATG	2	10	5017	5026	60 %	20 %	20 %	0 %	337754021
131	NC_015696	T	6	6	5100	5105	0 %	100 %	0 %	0 %	337754021
132	NC_015696	TTTGAT	2	12	5119	5130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	337754021
133	NC_015696	GAT	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754021
134	NC_015696	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337754021
135	NC_015696	AAC	2	6	5167	5172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337754021
136	NC_015696	T	6	6	5284	5289	0 %	100 %	0 %	0 %	337754021
137	NC_015696	TA	3	6	5292	5297	50 %	50 %	0 %	0 %	337754021
138	NC_015696	TGA	2	6	5316	5321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754021
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404	NC_015696	GTA	2	6	17239	17244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754034
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